계산은 언제든 어떤 이유에서든 종료될 수 있습니다.

어떻게 하면 끊어진 계산을 다시 그 지점부터 시작할 수 있을까요?

아래의 사이트를 참고하면, 그 해답을 알 수 있는데,

Managing long simulations - GROMACS 2022.3 documentation

곧, 아래의 커맨드 한 줄이 멈춘 우리의 계산을 재진행시킬 수 있습니다.

gmx mdrun -v -deffnm [계산 실행할 tpr 파일 이름] -cpi [계산이 종료될 시 출력된 .cpt 파일명] -append 

즉,

• 처음 계산에 사용한 .tpr 파일
• 계산 종료 시 출력된 .cpt (체크포인트) 파일
• -append 옵션

이 세 개만 있으면 계산을 그 시점부터 다시 진행할 수 있습니다.

-cpi 옵션을 이용하여 중간에 종료된 계산을 다시 재진행해보세요.

⚠️ -noappend를 입력하는 순간 0 ns부터 다시 계산이 진행되므로 조심하세요.